商船队（TheMerchantFleet）

商船队拥有帝国的近90%的（可进行恒星际航行的）宇宙飞船。每个商船队都以帝国的五个星域之一为基地活动，其行政人员在每个星域的星域堡垒上工作。例如：太阳商船队的基地设在火星，而北部地区——朦胧星域——的商船队的基地就设在奇普拉·蒙迪。尽管这些舰队基地拥有巨大的港口，港口里配有船坞、造船厂和修理设施，舰队基地的主要作用还是管理在其管辖范围内的商船队的活动。只有一小部分船只曾经到在理论上它们所隶属的星域堡垒。

每一艘商用船只都要与商船队签订一份协议，这种协议叫做贸易契约（merchantcharter），签订了契约的船只要按照契约为商船队服役。契约并非千篇一律的——有些契约能给签约的船长提供比其他人更大的权力和更多的责任——但所有契约的形式都是封建式的宣誓效忠，船长要向代表皇帝的商船队当局宣誓，然后还要将宣誓记录在他所属星域的星域堡垒与火星上的星域堡垒中，这些手续完成之前，船长不得为他的船只注册。

民船队（CivilFleet）

尽管帝国的绝大多数星际飞船都隶属于商船队，仍然有数千艘船只是登记为个人、家族或贸易卡特尔所有的。所有的私人船只都要在授权给他们的航线上航行，这些航线是由各星域的负责管理航运的舰队当局授权给他们的。私人船只必须购买在某条特定航线上航行的许可证，在一段固定的时间（通常是一百年）之后还必须换新证。这意味着只有很少的私人船只会去冒长途航行带来的时间膨胀效应的险，因为当一艘船完成它的航行之后，许可证可能已经过期了！

民船队的大小不一，有的只有一艘船，有的可能有几打。最庞大的民船队之一是属于导航者家族中的雷东多（Redondo）家族所有的，一共拥有47艘星际飞船。大部分私人船主只有一艘船只。

战争舰队（Warfleet）：

每个星域都有一支战争舰队，其作用是保护该星域的航运。

大部分宇宙战斗发生在空间设施和行星上，其中大部分的战斗中，仅靠（不能进行异空间航行、只能在行星系内航行的）星系内舰船和以行星为基地的防御系统就能有效地进行防御。尽管如此，为所有帝国的世界提供防御是不可能的。帝国海军的作战舰艇拥有很高的机动性和威力巨大的武器，在需要的时候能够很快集结起来应付较大的威胁。

作战舰艇的舰长跟他们在商船队中的同行一样，都是帝国的仆役。不过，所有作战舰艇的舰长都要由该星域的行政官员指派，并且对他们所指挥的船只没有所有权。战争舰队的组织体系比商船队的更加严格，有着跟帝国的地面部队一样森严的等级关系。

作战舰队（Battlefleet）

帝国的疆域广阔无垠，其中有许许多多的星系和蛮荒地带要巡逻，尽管帝国海军拥有数以千计的船只，分摊下来，每个地方

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